Selçuklulardan günümüze kadar varlığını devam ettirmiş olan yapı 1997 yılına kadar siyasi ve düşünce suçundan yargılanan mahkumların cezasını çekmesine ev sahipliği yapmıştır. Necip Fazıl, Refik Halit Karay gibi isimlerin kaldığı Sinop cezaevi şu an müze olarak kullanılmaktadır.